Il Consiglio dell'Università per la Pace è l'organo di governo dell'Università ed è composto da 17 membri , in conformità con la Carta dell'UPEACE . Dieci membri sono nominati dal Segretario Generale delle Nazioni Unite in consultazione con il Direttore Generale dell'UNESCO, e sette sono membri di diritto: il Cancelliere dell'Università, il Rettore, due membri nominati dal Governo del Costa Rica – paese ospitante – un rappresentante del Segretario Generale delle Nazioni Unite, un rappresentante del Direttore Generale dell'UNESCO e il Rettore dell'Università delle Nazioni Unite.
Di seguito sono elencati gli attuali membri del Consiglio dell'Università per la Pace.
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